В 2002 году состоялась презентация iPod classic 2-го поколения. Новый плеер имел кнопку переключения Home, порт FireWire теперь закрывался крышкой, а колесо управления стало сенсорным. Внешний вид айпода тоже немного изменился: края у передней панели сделали закругленными. Всего выпускалось 2 конфигурации на 10 Гб и на 20 Гб, стоимость составляла 400 и 500 долларов соответственно. Также были выпущены модели, совместимые с Windows. Кроме того, была выпущена лимитированная серия iPod classic 2-го поколения с автографами Мадонны, Тони Хока или No Doubt
на задней панели.

В 2003 году вышел iPod classic 3-го поколения. Основным новшеством явилось замена порта FireWire новым портом для синхронизации. Модель оснащена сенсорным колесом и имеет немеханический интерфейс. Появились 4 дополнительные кнопки управления, расположенные под экраном. Внешний вид айпода практически не изменился. iPod classic 3 g выпускался с объемом память 10, 15 и 30Гб. Все модели были совместимы с Mac и Windows. Стоимость  iPod clasic 3 g
на 30Гб составляет 500 долларов.

Позже появилась модель на 40Гб, которая синхронизировалась при помощи iTunes 4.1 – первой версией, доступной для Windows.